公司高度重視產學研合作，多年來與高校、科研院所開展各種形式的產學研合作，加強科技成果轉化，提高企業自主創新能力和市場競爭力。2011年公司被認定為浙江省產學研示范企業。目前，已與浙江大學、天津中醫藥大學、北京大學、中國藥科大學、中國科學院上海藥物所、中醫科學院、中國藥科大學等開展產學研合作。

2010年，公司牽頭建立了浙江省中藥現代化產業技術創新戰略聯盟。聯盟成員單位有浙江省中藥研究所有限公司，浙江大學藥學院、浙江中醫藥大學藥學院、浙江工業大學藥學院、浙江康恩貝制藥股份有限公司、杭州胡慶余堂藥業有限公司、浙江中醫藥大學中藥飲片有限公司、浙江中信藥用植物種業有限公司、浙江天科高新技術發展有限公司、杭州朱養心藥業有限公司、浙江省中藥材產業協會。